Τα αδύνατα σημεία των χαμηλού κόστους συστημάτων είναι:

• Περιορισμένες δυνατότητες, δηλαδή κάνουν ένα μικρό μόνο μέρος από όσα κάνει ένα ολοκληρωμένο σύστημα διαχείρισης πελατειακών σχέσεων. Συνήθως είναι επικεντρωμένα σε μια κυρίως λειτουργία.

• Λογισμικό κλειστού κώδικα, δηλαδή γρήγορα θα είναι άχρηστα για έναν επαγγελματία αφού δεν θα μπορούν να κάνουν κάτι καινούργιο που θα χρειαστεί.

• Πρόσφατα έχουν εμφανισθεί και συνδρομητικά συστήματα CRM χαμηλού κόστους που εκτός των προηγούμενων αδυναμιών, έχουν και το χαρακτηριστικό ότι η επιχείρηση ουσιαστικά δεν είναι κάτοχος του προϊόντος.

Τα αδύνατα σημεία των υψηλού κόστους συστημάτων είναι:

• Υψηλό κόστος εγκατάστασης και συντήρησης.

• Πρόσθετο κόστος ανά χρήστη (άδειες χρήσης)

• Η επέκταση σε νέες λειτουργίες γίνεται αποκλειστικά και μόνο από την εταιρεία που το προμηθεύει.

Το πρώτο στοιχείο που πρέπει κανείς να προσέξει κατά τη διαδικασία επιλογής CRM συστήματος για την επιχείρησή του, είναι το τι ακριβώς κάνει το CRM που εξετάζει.
Το επόμενο στοιχείο είναι η δυνατότητα σύνδεσης με άλλα συστήματα (π.χ. μέσω γέφυρας). Ένα άλλο πολύ σημαντικό θέμα είναι η δυνατότητα επεκτασιμότητας του συστήματος και φυσικά οι ικανότητες της προμηθεύτριας εταιρείας σε αυτό το θέμα.